¿Cuáles serán los retos para la F-104 durante su etapa dentro de la operación Atalanta contra la piratería? Variados.
Como unidad de mando tendrá que ocuparse de enlazar y coordinar todas las órdenes que lleguen desde tierra y, por ejemplo, determinar actuaciones de otras unidades, por lo que el departamento de Comunicaciones jugará un papel determinante.
Al margen, cumplirá con las labores habituales de cualquier barco de guerra desplazado a la misión. La Fuerza Naval de la Unión Europea (Eunavfor) opera en aguas del golfo de Adén, Cuerno de África y Océano Índico, desde finales del 2008, bajo el amparo de diversas resoluciones del Consejo de Seguridad de Naciones Unidas, para la protección contra la piratería de los buques del Programa Mundial de Alimentos que transportan ayuda humanitaria a Somalia, país devastado por la hambruna, la sequía y los enfrentamientos entre clanes, así como la protección y apoyo a buques de las Fuerzas de la Misión Africana en Somalia y otros mercantes que transitan por la zona.
La operación Atalanta y la presencia cada vez más abundante de seguridad privada a bordo de los pesqueros ha conseguido que este año haya descendido el número de ataques piratas con respecto a otros ejercicios, pero esas aguas siguen siendo muy peligrosas.